公積金還款日余額不足會有二次扣款的，在還款日當天，公積金系統會有兩次扣款失敗，分別是上午和下午。

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除此之外，公積金中心有規定，如果借款人的公積金貸款上一期為正常還款狀態，在合同約定還款日次日，給予一次補扣機會，若是扣劃再次失敗，貸款狀態在補扣日當日轉為逾期，并自補扣日按最低還款額開始計收罰息。

也就是說，借款人如果上期還款是正常的，那么到了本期公積金還款日，還款卡余額不足，第二天公積金系統會進行二次補扣。只要補扣成功，就不屬于逾期。

公積金系統的扣款時間暫時是沒有固定的，但是也有一定的規律遵循。如果連續幾個月，借款人的公積金貸款都在同一個時間扣款成功，那么后續基本上也不會有太大的變動。

公積金扣款方式總共有三種：

1、銀行卡扣款

借款人綁定一張銀行卡為還款卡，到了還款日系統會從綁定的銀行卡里面扣款。

2、公積金賬戶余額扣款

系統會在借款人貸款的公積金賬戶內，每個月，或者每年進行扣款還款。這種還款方式也被稱為公積金對沖還款。借款人在申貸時，就需要委托銀行提取個人公積金賬戶余額里的錢去還貸款月供。

3、提取公積金賬戶的錢還款

還房貸期間是可以從公積金賬戶里面提取資金還房貸的，比如你每年從公積金里面提取一次，用來提前還房貸。

公積金扣款夫妻可以一起扣嗎?

公積金扣款夫妻不可以一起扣，因為公積金扣款是按一定的順序進行的，具體如下：

1、主貸人公積金扣款

主貸人是貸款合同中的主要借款人，負責還款義務。因此，代扣銀行會優先從主貸人的公積金賬戶扣除當月還款金額。主貸人的公積金賬戶余額足夠支付當月還款金額，不會啟用次貸人的扣款，也不會再進行扣款。

2、次貸人公積金扣款

如果主貸人的公積金賬戶余額不足以支付當月還款金額，代扣銀行會從次貸人的公積金賬戶扣款。次貸人是貸款合同中的輔助借款人，其公積金賬戶可以作為補充支付來源。

3、主貸人銀行卡扣款

如果主貸人和次貸人的公積金賬戶余額都不足以支付當月還款金額，代扣銀行會從主貸人的銀行卡扣款。這是為了確保還款的順利進行，盡可能避免逾期情況。

4、次貸人銀行卡扣款

如果前面的方式都沒還清當月還款金額，代扣銀行最后會從次貸人的銀行卡扣款。如果次貸人銀行卡里資金也足以支持本次扣款，則夫妻雙方的公積金貸款都會逾期。

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